• pucačina
• pucanje
• čudovišta

Započinjete igru kao neimenovani svemirski marinac (Doom fanovi ga nazivaju Doomguy), jedan od najjačih i najiskušenijih u bitci koji je bio deportiran na Mars zbog napada na višeg oficira koji mu je naredio da pobije nenaoružane civile. Zbog toga je glavni lik u igri prisiljen raditi za Union Areospace korporaciju (UAC), vojno-industrijski konglomerat koji provodi tajne eksperimente s teleportacijom između dva mjeseca Marsa (Fobos i Deimos). Iznenada, nešto krene po zlu te stvorenja iz pakla (Hell) dolaze iz teleportacijskih vrata. Obrana baze nije izdržala invaziju, te se sada u njoj nalaze demoni; svo osoblje je ubijeno i pretvoreno u zombije. Istovremeno mjesec Deimos isščezne potpuno. UAC tim sa Marsa je poslan na mjesec Phobos da analizira nesreću, ali se ubrzo gube radio kontakti sa svima osim sa glavnim likom igre čiji je jedini zadatak pobijeći živ.

Kako bi prešli igru morate se boriti kroz tri epizode od kojih svaka sadržava devet razina. Knee-Deep in the Dead je prva epizoda, te ujedno i jedina u ovoj flash verziji, a smiještena je u visoko tehnološkoj vojnoj bazi na Fobosu. Završava bitkom s Barrons of Hell bićima, te kasnije ulaskom u teleporter koji vodi na Deimos mjesecu. Tamo igrać biva nadjačan od strane različitih stvorenja i vidljivo mrtav. U sljedećoj epizodi Shores of Hell igrač putuje kroz Deimos i njegova postrojenja, čija područja su ispunjena gadnom arhitekturom. Nakon susreta sa Cyberdemon-om, istina o iščeznulom mjesecu dolazi na vidjelo. Mjesec pluta iznad pakla (Hell). Igrač se spušta na površinu, te u poslijednjoj epizodi Inferno započinje pravu avanturu. Nakon uništenja poslijednjeg šefa (boss) Spider Mastermind-a, tajna vrata se otvaraju za heroja koji se dokazao prečvrstim za sadržaj pakla. Ta vrata vode Zemlji.

• strelice = kretanje
• shift = rotiranje
• ctrl = pucanje
• space = otvaranje vrata